Ipswich PC -1186 - Tarix

Ipswich PC -1186 - Tarix



We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

İpsviç

(PC-1186: dp. 295, 1. 174 '; b. 23'; dr. 8 '; s. 19 k.; Cpl.
65; a.13 '', 140mm., 220mm., 2rkt., 4dcp., 2dct.)

PC-1186, Gibbs Gas Engine Co., Jacksonville, Fla., 20 aprel 1943-cü ildə qoyulmuşdur; 27 sentyabrda başladı; Xanım George Wharton tərəfindən sponsorluq edildi və 9 İyun 1944 -cü ildə Lt. (j.g.) Paul L. Adams komandirlik etdi.

PC-1186, Mayami, Florida ştatındakı sarsıntıdan və ASW təlimindən sonra Atlantikdəki konvoy müşayiət vəzifəsinə təyin edildi. Avqustdan dekabr ayına qədər Yeni İngiltərə sahillərindən Kubanın Guantanamoya qədər müşayiət, patrul və kəşfiyyat vəzifələrini yerinə yetirdi. 1944 -cü ilin dekabr ayının sonlarında Panama Kanalı ilə Kuba arasındakı patrul və müşayiət əməliyyatları üçün Coco Solo, C.Z. -ə gəldi.

PC-1186 bu xidmətləri İkinci Dünya Müharibəsinin qalan hissəsi üçün davam etdirdi. Müharibədən sonra Kanal Bölgəsində patrul xidməti apardı və 7 May 1946 -cı ilədək Charleston, SC -yə gedənə qədər sualtı qayıqlarla təlim məşqləri etdi. 22 iyul 1946 -cı ildə Nyu -Yorkda istismardan çıxarılan və Bostonda doğulduğu müddətdə Atlantik Ehtiyat Donanmasına qoşuldu. PC-1186, 15 Fevral 1956-cı ildə Ipswich olaraq adlandırıldı. Ipsich ~ 1 Aprel 1959-cu ildə Hərbi Dəniz Qüvvələrinin Siyahısından çıxarıldı və 16 Sentyabr 1959-cu ildə Hughes Brothers, Inc-ə satıldı.


Ipswich Məktəbi – qısa bir tarix

Bu təvazökar mənşələrdən, məktəbin ilk tarixi keçmiş şagird Thomas Wolsey -in hakimiyyətə gəlməsi ilə çox fərqli bir istiqamət aldı. Wolsey, şagirdlərini Oxforddakı kollecinə təmin etmək məqsədi ilə məktəbi yenidən qurmağa başladı. Wolsey -in etibarlı müşaviri Tomas Cromwell, vəzifəni üzərinə götürdü və məktəbə pul ödəmək üçün on iki yerli monastırı ləğv etdi.

Ancaq bir ildən bir az sonra, Henry VIII üçün çox lazım olan boşanma təmin edə bilməyən Wolsey, lütfdən düşdü və monarx yeni məktəbini bağlamaq istədi. Yeni məktəb binaları üçün nəzərdə tutulmuş daşlar İpsviçdən Londona göndərildi və indiki Whitehall Sarayını tikmək üçün istifadə edildi. Əksinə, Ipswich Məktəbi sağ qaldı. Cromwell inandırdı
Henry, ilk Elizabeth tərəfindən təsdiqlənən ilk nizamnaməsini məktəbə verdi.

On doqquzuncu əsrə qədər Ipswich Məktəbi Christchurch Parkının yanındakı indiki yerə köçdü. Şahzadə Albert əsas məktəb binasının təməl daşını 1851 -ci ildə qoydu. Bundan qısa müddət sonra 1883 -cü ildə Hazırlıq Məktəbi
7-11 yaş arası uşaqlar üçün qurulub. 2006 -cı ildə təəccüblü yeni binasına köçdü.

Ipswich Məktəbi, bir çox tanınmış keçmiş şagirdləri iddia edə bilər: Thomas Wolsey, Kardinal, York Başpiskoposu və Henry VIII altında İngiltərə Lord Kansleri, demək olar ki, məktəbə getdi. Görkəmli hərəkət adamları arasında Flodden döyüşündəki İngilis komandiri Norfolk Dükü Thomas Howard və kontr -admiral Sir Philip Broke var. USS Chesapeake ilə ünlü bir nişanda HMS Shannon -un kapitanı oldu. Yazıçı Henry Rider Haggard, 1870 -ci illərdə burada şagird idi və Sir Edward Poynter, Kral Akademiyasının prezidenti, Punchdan Charles Keene və Edward Ardizzone kimi görkəmli sənətçilər məktəbdə oxudular. Elm sahəsində, qabaqcıl nöro-fizioloq və Nobel mükafatçısı Sir Charles Sherrington, bu günə qədər ən çox seçilən Old Ipswichian'dır.


Tarixi tarix

Sümük Dedektifleri, Tori Herridge və bir qrup elm adamının ortaya çıxarılan sümüklərin arxasında həyat hekayələrini bir araya gətirdiyi bir Kanal 4 proqramıdır.

Son bölümdə, komanda 1400 cəsədin ağır iş, xəstəlik, qətl və bəlkə də ölkənin ilk ölümündən sonra ölüm əlamətlərini ortaya qoyduğu Ipswichdəki çoxdan unudulmuş bir məzarlığa diqqət yetirir.

Məndən prodüser qrupu proqram üçün apardıqları bəzi araşdırmalara kömək etmələrini istədi və sonra epizodda qısa bir müsahibədə iştirak etməyə dəvət etdim.

Bunu paylaş:

Bunun kimi:

IPSWICH TARİXİ PODKAST BÖLÜM 6

IPSWICH VƏ HANSEATİK LİG

Bu epizodda Ipswich Maritime Trust-dan Pat Grimwade ilə Hansa Liqası arasında az tanınan Ipswich haqqında yeni nəşri haqqında danışıram.

Hanseatik Liqa, bir zamanlar Orta Orta əsr Avropa ticarətinin çox hissəsinə hakim olan, Almaniya, Hollandiya, Skandinaviya, Baltikyanı və İngiltərədəki bir neçə limanı İpsviç də daxil olmaqla bir çoxuna hakim olan tacir qızıllar konfederasiyası idi. Hansa Liqası zirvəsində Danimarkaya qarşı müharibədə qalib gələn bir hərbi qüvvəni bir araya gətirdi.

Pat, İpsviçin Hansa limanı olmağa necə gəldiyini, o dövrdə İpsviçdən hansı əşyaların alınıb -satıldığını və bu gün şəhərin Hansa əlaqələrinin hansı fiziki sübutlarının qaldığını izah edir.

Danzigdən (müasir Qdansk, Polşa) və Elbingdən (müasir Elbląg, Polşa) və Ipswich-in öz şəhər möhüründən bu orta əsr möhürləri arasında təəccüblü oxşarlığı görə bilərsinizmi? Podcastın bu bölümündə də bu barədə daha çox məlumat əldə edin.

İTunes, Spotify və s.-də podkasta qulaq asa və abunə ola bilərsiniz və ya onlayn yayımlaya bilərsiniz: https://anchor.fm/caleb-howgego

Bunu paylaş:

Bunun kimi:

IPSWICH TARİXİ PODKAST BÖLÜM 5

ERKƏN TARİXİ İPSVİÇ

Bu bölümdə Suffolk County Council Arxeoloji Xidmətindən Hannah Cutler ilə erkən tarixdən əvvəlki Ipswich haqqında bir söhbət var.

Hannah, bir gün İpsviçə çevriləcək ərazinin Paleolit ​​(Köhnə Daş dövrü) və Mezolit (Orta Daş Dövrü) dövründə necə olduğunu danışır. Hannah, https://heritage.suffolk.gov.uk saytına daxil olaraq ictimaiyyət üzvlərinin özləri üçün araşdıra biləcəyi onlayn məlumatların təkmilləşdirilməsini ehtiva edən bu sahə üçün Tarixi Ətraf Mühitinin Qeydini yeniləmək üçün hazırda gördüyü işlərdən də danışır. /

Erkən qadın arxeoloq və antikvar Nina Layard da daxil olmaqla, erkən tarixdən əvvəlki tapıntıların bəzi tarixi yerli qazıntılarını da eşidirik.

İTunes, Spotify və s. Dinləyə və ya onlayn olaraq izləyə bilərsiniz: https://anchor.fm/caleb-howgego

Nina Layard, əlindəki qazma, 1903-1905-ci illərdə İpsviçdəki Foxhall Yolu qazıntılarına rəhbərlik etmişdir.

Bunu paylaş:

Bunun kimi:

IPSWICH TARİXİ PODKAST BÖLÜM 4

Orwell çayı üzərindəki Orwell körpüsü

ITunes, Spotify və s.-də podcast axtararaq və ya onlayn yayımlayaraq epizodu dinləyə bilərsiniz: https://anchor.fm/caleb-howgego

Bu bölümdə Andy Parker ilə 1519 -cu ildə Kral Henry VIII tərəfindən Orwell çayının İpsviçə necə hədiyyə edildiyini və niyə İpsviçin bir çaya sahib olan ölkənin yeganə şəhəri olduğu haqqında danışıram.

Andy, Orwell və Ipswich çayının heyrətamiz dəniz tarixini və irsini qorumaq və təbliğ etmək istəyən Ipswich Maritime Trust üçün könüllüdür. Andy, Ipswich Star üçün İpsviçə Orwell çayının necə hədiyyə edildiyini izah edən bir məqalə yazdı və bu linki izləyib oxuya bilərsiniz:

Həm də atam David Howgego ilə necə İpswichdən bir Freeman olmağı və Freemanın bu gün hansı əlavə hüquqlara (əgər varsa) sahib olduğunu danışıram.

Bunu paylaş:

Bunun kimi:

IPSWICH TARİXİ PODKAST BÖLÜM 3

Podcastların bu kiçik epizodu, Rushmere St. Andrewdəki Ipswich'in şərq kənarında yerləşən Kestane Göletinin tarixinə və keçmiş qaçaqmalçılıq əlaqələrinə nəzər salır.

Pişik Evi adlanan bir yerin bir vaxtlar Orwell çayı üzərindəki qaçaqmalçılıqda necə rol oynadığına dair başqa bir yerli əhvalatı təkrarlayır.

Epizodu iTunes, Spotify və s.-də tapa və ya onlayn yayımlaya bilərsiniz: https://anchor.fm/caleb-howgego

Bunu paylaş:

Bunun kimi:

BBC RADYO SUFFOLK MÜSAHİBƏSİ

Bu yaxınlarda Lesley Dolphin ’s BBC Radio Suffolk proqramına divan qonağı olaraq yerli tarixdən və onunla necə maraqlandığımdan danışmaq istədim. Bu, 16 Mart 2020 -ci ildə yayımlanan proqramdan aldığım müsahibədən gələn səsdir.

Bunu paylaş:

Bunun kimi:

ŞƏHƏR DUVARLARI

Ipswich həmişə bu gün tapdığımız nisbətən sülhsevər bir şəhər deyildi. Bir zamanlar, bəzən hətta qitə qarətçilərindən basqınlara məruz qalmışdı. Orta əsrlər Ipswich sakinlərinin şəhərlərinə daha çox təhlükəsizlik gətirməyə çalışdıqları yollardan biri müdafiə perimetri qurmaq idi. Bu gün Ipswich -də qədim bir şəhər divarından əsər -əlamət qalmamış kimi görünür, buna görə şəhərin müdafiə sistemləri nələr idi və nə vaxt yoxa çıxmışdılar?

1203 -cü ildə qazılan şəhər xəndəklərindən bəhs edən bir rekord sağ qaldı, lakin bu daha da qədim bir müdafiə xəttinin uzadılmasına aid ola bilər. Sonrakı bir neçə əsr ərzində sənədlərdə şəhər divarlarına bəzi istinadlar edilsə də, daha çox müdafiə "şəhərin böyük xəndəkləri" adlandırılır. 1604 -cü ildə divarların üstünə çınqıl yolunun qoyulması əmri, bu nöqtədəki surların hamısının olmasa da, əksəriyyətinin daş divar deyil, torpaq sahil olduğunu göstərir. Bu səbəbdən müdafiənin ən zəif nöqtələrində onları birləşdirən divarları olan bir xəndək və torpaq surlardan ibarət olması ehtimal görünür. Bu müdafiə xətti Ipswichin qərb, şimal və şərq kənarları boyunca əyilmiş olardı - şəhərin cənub kənarı Orwell çayına qədər uzanırdı. Şəhər böyüdükcə, surlar xaricində icmalar inkişaf etdi, lakin içəridə olanlar imtiyaz üçün daha çox vergi ödəsələr də daha çox təhlükəsizliyə sahib idilər.

İstifadə edildiyi daş divarların nə qədər az olduğu görünsə də, şübhəsiz ki, şəhərin ətrafının ətrafında fasilələrlə qoyulmuş daş qapılar var idi. Ipswich tarixən bir hərbi qaladan daha çox ticarət mərkəzi olmuşdur və qapılar ticarətin tənzimlənməsi üçün təhlükəsizlik baxımından çox istifadə edilmişdir. Yük arabaları ilə yüklər bu qapılara çatacaq və ya şəhərə girməyə icazə veriləcək və ya rədd ediləcək. Bunlardan ən təsirli olanı, 1448 -ci ildə uzun illər boyunca bir dəzgah evinə çevrilən döyüş qapıları olan təsirli bir quruluş olan West Gate idi.

John Speed ​​’s -in 1610 -cu il xəritəsinin diqqətlə yoxlanılması şəhərin divarlarını göstərir (xüsusən şəhərin şimalında aydındır. Açarda müxtəlif şəhər qapıları da var.

Westgate 1780 -ci illərdə söküldü və 1900 -cü illərin əvvəllərində demək olar ki, bütün surlar, xəndəklər və qapılar yox oldu. Keçmiş müdafiə yerlərindən birinin görünə biləcəyi son açıq yer, şəhərin şimalında, bəzi Viktoriya Evlərinin torpaq sahilin üstündə yerləşdiyi yer idi. Bu ərazi daha sonra düzəldilərək avtomobil dayanacağı üçün bir yerə çevrildi və daha sonra Tower Rampartsdakı avtovağzal oldu.

Tower Ramparts ticarət mərkəzinin 2014 -cü ildə yenidən qurulmadan və çəkilməsindən əvvəl çəkilmiş fotoşəkil

Fiziki qalıqlar yoxa çıxsa da, surların və qapıların xatirəsi bu gün Ipswichdəki Tower Ramparts və Northgate Street kimi yer adlarında və küçə adlarında yaşayır. Şimal Qapısının son izlərinin bu binanın zirzəmisinə daxil edildiyi söyləndiyi üçün şəhər müdafiə sistemlərindən birini görməyimizə ən yaxın olanı Halberd Inn ziyarətidir.

Bunu paylaş:

Bunun kimi:

IPSWICH TARİXİ PODKAST BÖLÜM 2

Epizod 2 – 17-ci əsr Ipswich və Şərqi Anglian Cadı Ovları

1645-ci ildə İngilis tarixinin ən böyük cadugər ovu başladı və Şərqi Anglia çətin bir mərkəzdə idi. Cadugərlik iddiaları ilə mühakimə olunandan sonrakı bir neçə il ərzində Şərqi İngiltərədə yüzlərlə adam asıldı. Bununla birlikdə, Ipswichdə yaşayan Mary Lackland adlı bir qadın, iddia etdiyi cinayətlərə görə yandırılmaqla xüsusilə ağır cəzaya məhkum edildi.

Podcastın bu bölümündə Devid Consla kitabı haqqında danışıram Ipswich Cadı, Mary Lackland və Suffolk Cadı Ovları.

17-ci əsrdə yaşayan Ipswich, David və Mary Lackland'ın məhkəmə və edamına səbəb ola biləcək şeylər, ifritəçilərin günahsızlıq və ya günahkarlıqlarını sınamaq üçün istifadə etdikləri üsullar haqqında həyatın necə olacağını danışırıq. ittiham olunur və 1640-cı illərdə ifrat dərəcədə ifritə sınaqlarının ortaya çıxmasının arxasında nə ola bilərdi.

Podcast iTunes, Spotify və digər podcast provayderlərində mövcuddur. Podcast tətbiqli bir cihaza girişiniz yoxdursa, bu linki izləyib Ipswich History Podcast -ı dinləyə bilərsiniz.

Bunu paylaş:

Bunun kimi:

50 BİNADA IPSWICH

Üzərində çalışdığım yeni bir kitabın çağırıldığını elan etməkdən məmnunam 50 Binada İpsviç 15 iyun 2019 -cu ildə nəşr olunacaq.

Kitabın nəşrini 6 İyul Şənbə günü saat 14: 00 -da Ipswich Muzeyində kitabın imzalanması tədbiri ilə qeyd edəcəyəm, kitabın muzey mağazasından da əldə oluna bilər. Hamısı iştirak etməkdən məmnundur – sizi orada görmək çox xoş olar!

Haqqında daha çox bilmək istəyirsinizsə, burada ’ lur 50 Binada İpsviç:

Ipswich, Anglo-Sakson köklərindən Şərqi İngiltərədəki Orwell çayı sahilində bir yaşayış yeri olaraq başlayan maraqlı bir tarixə malikdir. O vaxtdan bəri şəhər İngiltərənin ən əhəmiyyətli limanlarından biri, orta əsrlər yun ticarəti mərkəzi idi və Viktoriya dövründə inkişaf edən bir sənaye mərkəzinə çevrildi. Ipswich -in fərqli tarixi, əsrlər boyu şəhəri formalaşdıran binalarda təcəssüm olunur, çünki ardıcıl nəsillər öz memarlıq izlərini buraxırlar.

50 Binada İpsviç Christchurch Mansion kimi möhtəşəm orta əsr kilsələrindən və Tudor xəzinələrindən Willis Binasının təməlqoyma dizaynı kimi müasir şah əsərlərinə qədər memarlıq incilərinin seçilməsi ilə şəhərin zəngin tarixini araşdırır. Müəllif və tarixçi Caleb Howgego, oxucunu şəhərin tarixi və müasir binalarına istiqamətləndirərkən Ipswich memarlıq irsini yeni və əlçatan bir şəkildə qeyd edir.

Bunu paylaş:

Bunun kimi:

BASIL Qəhvəyi Hadisə

Bildiyiniz kimi, bu bloqun uzun müddət oxuyucusunuzsa, Suffolk Arxeoloqu Basil Braunun böyük bir pərəstişkarıyam. Bu ilin əvvəlində onun haqqında bir podcast hazırladım, burada dinləyə bilərsiniz

Ipswich Muzeyində Basil Braunla (bir vaxtlar İpsviç Muzeyində muzey xadimi olan) bağlı bir Muzey sirləri tədbirinə 25 Noyabr 2018, 2.15-3.15 pm-də rəhbərlik edəcəyəm. Pulsuzdur və açılış tədbiridir, buna görə iştirak etmək üçün heç bir kitab sifariş etməyinizə ehtiyac yoxdur.

Tədbir haqqında daha çox məlumatı bu linkdən əldə edə bilərsiniz: Muzey sirləri - Basil Brown: Suffolk Arxeoloqu


Altıncı forma

Səviyyə Tarixi, təhlil bacarıqlarınızı və inandırıcı, aydın arqumentlər yazma qabiliyyətinizi artıracaq maraqlı və çətin bir kurs təqdim edir. Bir İncəsənət, Sosial Elm və ya Elm dərəcəsi üçün müraciət etməyinizdən asılı olmayaraq rəqabətli universitetlər tərəfindən yaxşı qiymətləndirilən bir keyfiyyətdir.

İxtisas sahələrində çalışan müəllimlərdən həvəslənəcəksiniz. Kurslar, departament tərəfindən yazılmış və geniş çeşidli kitablarla dəstəklənən materiallardan istifadə etməklə verilir.

Şəxsi maraqlarınız inkişaf etdikcə daha çox oxumaq istiqamətinə yönləndiriləcəksiniz. Həm həmyaşıdlarınız, həm də müəllimlərinizlə mübahisə etməyə və mübahisə etməyə təşviq olunacaqsınız. Vaxt keçdikcə müstəqil işləyəcəyiniz və özünü təmin edən bir şagird olacağınız gözlənilir. Ən əsası, müasir tarixin ən maraqlı və mübahisəli tərəflərindən bəzilərini əhatə edəcəksiniz.

12-ci ildə, 1918-1989-cu illər arasındakı Almaniya və Qərbi Almaniya tarixini, o cümlədən İkinci Dünya Müharibəsinin səbəbləri ətrafında tarixi mübahisələri araşdırırıq. Buna c1911-1946-cı illərdə İtaliyada faşizmin yüksəlişi və süqutu haqqında bir məqalə də əlavə olunur. 13-cü ildə İrlandiya ilə Birlik c1774-1923 arasındakı əlaqəni nəzərdən keçirəcəyik. Tələbələrin Holokostla əlaqədar tarixi bir müzakirə mövzusunda müstəqil bir əsər hazırlayacaqları bir kurs modulu da var.

İmtahan heyəti Edexcel -dir. İmtahan ərəfəsində geniş bir yoxlama proqramı təqdim olunur.

"Lids Universitetindən Beynəlxalq Tarix üzrə birinci dərəcəli diplom aldım ... və həqiqətən də inanıram ki, sizin davamlı dəstəyiniz və təşviqiniz olmadan bu mümkün olmazdı." Keçmiş A Səviyyə Tarix tələbəsi.

Ipswich Məktəbi Tarix Bölməsini twitterdə @IpswichHistory -də izləyin.

İmtahan nəticələri

Tarixdəki ən son üç illik dövrdə əldə edilən nəticələrin ortalaması:


Tarix

Əvvəlcə məqsədyönlü olaraq inşa edilmiş Viktoriya dövrünə aid bir binada, muzey, kitabxana və sənət qalereyasının funksiyaları birləşdirildi. Kitabxana 20 -ci əsrin əvvəllərində çıxarıldı, ancaq İncəsənət Qalereyası və Muzey 1970 -ci illərdə binaları paylaşmağa davam etdi.

Muzeylər ilham olaraq

Muzey və İncəsənət Qalereyası əlaqələndirildikdə, muzey kolleksiyaları həm şagirdlərin, həm də işçilərin işlərinə birbaşa ilham verirdi. Maggi Hambling -in ilk əsərlərindən və Bernard Reynolds quş heykəllərindən bəziləri açıq bir əlaqə təmin edir.

Bir çox digər rəssam, muzey kolleksiyalarından, xüsusən də müasir muzeylərin mənşəyini təşkil edən və ruhu hələ də Pitt çayları və ya Viktoriya Qalereyası kimi bəzi müasir muzeyləri canlandırmağa davam edən 'maraq dairələri' ideyasından ilham almışdır və olmağa davam edir. Ipswich Muzeyində. Damien Hirstin ilk əsərləri bu mövzudan birbaşa ilham aldı.

Mark Dion kimi bir sıra görkəmli sənətkarlar, əsərləri üçün elmi və muzey kataloqlaşdırma və təsnifat ideya və sistemlərindən istifadə etməyə davam edirlər.

Bir muzeyin, xüsusən də Maraqlar Kabineti ideyasının və müasir incəsənətin uzun və hörmətli bir ənənəsi var və yeni birləşmiş məkanda təcəssüm etdirilməyə davam edəcək bir şey var.

20 -ci əsr Sənəti

Benton End Group (bəzən Şərqi İngilis Rəsm və Rəssamlıq Məktəbi olaraq da adlandırılır) Cedric Morris (1889-1982) və Arthur Lett Haines (ö.1978) tərəfindən açıldı, əvvəl 1937-ci ildə Dedhamda və 1940-cı ildən 1970-ci illərin sonuna qədər Bentonda açıldı. Sonda, Hadleigh Suffolk yaxınlığında. Bir çox Suffolk rəssamına böyük təsir etdi və qırx il İngiltərənin şərqində sənət tədrisinə həyati töhfə verdi.

Benton End çox özünəməxsus xətlər üzərində işləyirdi. Rəsmi tədris yox idi, daha çox sənətkarların potensiallarını araşdıra biləcəkləri bir mühitin yaradılması. Atmosfer bir çox sənətçiyə ilham verdi və digərləri arasında Lucien Freud və Maggi Hambling -in erkən karyeralarında formalaşan bir təcrübə oldu. Cedric Morris, Arthur Lett-Haines, Maggi Hambling, Lucy Harwood, Joan Warburton və Glyn Morgan da daxil olmaqla Benton End ilə əlaqəli rəssamların Ipswich kolleksiyasında artıq bir neçə rəsm var. Cedric Morris və qrupdan təsirlənən digər görkəmli simalar arasında Beth Chatto da vardı.

Ipswich İncəsənət Məktəbi, kolleksiyada təmsil olunan Bernard Reynolds, Leonard Squirrel, Lawrence Self və Colin Moss da daxil olmaqla bir çox istedadlı rəssam, heykəltəraş və çap işçilərini heyətinə cəlb etdi. Bəzi görkəmli tələbələr arasında Maggi Hambling və Brian Eno var.

İki məktəbin yaxınlığı, bir çox sənətçinin hər ikisi ilə əlaqəsi olduğu və ya Maggi Hambling və Bernard Reynolds da daxil olmaqla kəsişdiyi anlamına gəlirdi. Hal -hazırda Cedric Morris də daxil olmaqla bu sənətçilərdən bəzilərinin əsərlərini həm sənət nümunələri olaraq, həm də necə işlədiklərini göstərmək üçün əhəmiyyətli dərəcədə artırmaq üçün bəzi imkanlar var.


İpsviç, Suffolk

1551 -ci ildə ölümündə varlı tacir Henry Tooley, İpsviç kasıblarına yardım və yaşayış təmin etmək üçün böyük bir məbləğ buraxdı. 1569 -cu ildə onun adına qurulan vəqf, şəhərin indiki Foundation Street -də olan keçmiş Dominikan prioryasını satın aldı və bu şəhərin ilk iş evinin Məsihin Xəstəxanası olaraq tanındığını təsbit etdi. Bura həm "günahsız" kasıblardan (yaşlılar, yetimlər, dullar və xəstələr), həm də "tənbəl" kasıblardan (avara, avara və dilənçilər) ibarət 40 məhbus yerləşdirilə bilər. 1574 -cü ildə ərazidə böyük bir yenidənqurma işləri aparıldı və 40 nəfərə tarama, iplikçilik və toxuculuq kimi işlərlə təmin etmək üçün emalatxanalar daxil edildi. Fərdi kilisələrin rahatlaşdırılması üçün məsuliyyət daşıyan 1601 Yoxsul Yardım Qanununun qəbul edilməsindən sonra, Məsih Xəstəxanası bələdiyyə iş evi olmağı dayandırdı və yoxsul uşaqları öyrətmək üçün bir xeyriyyə məktəbi rolunu aldı.

1777 -ci il parlament hesabatı, Ipswich'te fəaliyyət göstərən bir çox kilise iş evlərini sadaladı: St Clement (70 məhbusa qədər yerləşmə ilə), St Helen (10), St Lawrence (25), St Margaret (100), St Mary in Elms ( 10), St Mary in the Key (25), St Mary Stoke (30), St Mary Tower (30), St Matthew (30), St Nicholas (20), St Peter (28) və St Stephen (24) .

1834 -cü ildən sonra

Ipswich Kasıb Hüquq Birliyi 9 Sentyabr 1835 -ci ildə quruldu. Əməliyyatı, aşağıda qeyd edildiyi kimi 14 tərkib hissəsini təmsil edən 20 ədəd seçilmiş Qəyyumlar Şurası tərəfindən nəzarət edildi (mötərizədəki rəqəmlər birdən çox olduqda Qəyyumların sayını göstərir):

Suffolk əyaləti: St Clement's (3), St Helen, St Lawrence, St Margaret (3), St Mary-at-Elms, St Mary-at-the-Quay, St Mary Stoke, St Mary-at-the-Town, St Matthew ( 2), St Nicholas, St Peter (2), St Stephen, Westerfield, Whitton.

1831 -ci il siyahıyaalınmasında Birliyə daxil olan əhali, Whitton (346 əhali) ilə St Clement (4,779) arasında dəyişən 20,528 və mdash idi. 1833-35 dövrü üçün orta illik pis faiz xərcləri 13685 və ya 13s.4d idi. 4d. əhalinin başına düşən məbləğ.

Great Whip Street İş Evi

Yeni Ipswich Birliyi, bir iş evi tikmək məqsədi ilə Məsihin Xəstəxanasından Great Whip Caddesindeki 3.5 hektar ərazini & funt sterlinqə satın aldı. Müqəddəs Pyotrun iş evi olaraq bilinən bina, 1836-7-ci illərdə £ 5685 qiyməti ilə tikilmiş və 400 məhbusa qədər nəzərdə tutulmuşdur. Memar, Hartismere və Bury St Edmundsdakı iş yerlərinin genişləndirilməsi sxemlərindən də məsul olan William Mason idi.

Great Whip Street binası qırmızı kərpicdən inşa edilmişdir. Layihəsi geniş şəkildə məşhur xaç forması və ya "kvadrat" dizaynını izlədi. Great Whip Streetdəki giriş blokunda idarə otağı və qəbul otaqları vardı. Arxa tərəfdə, səkkizguşəli mərkəzdən dörd yaşayış qanadı yayılır. Xarici perimetri birmərtəbəli atelye və təsərrüfat binalarından əmələ gəlmişdir. Daha sonra binanın arxasına bir şapel və bir revir bloku əlavə edildi. İş evinin yeri və düzeni aşağıda 1884 -cü ildə göstərilmişdir.

Ipswich Great Whip Street iş yeri, 1884.

Heath Road İş Evi və Xəstəxanası

1898-9-cu illərdə Woodbridge Road-un cənub tərəfindəki yaşıl tarlada yeni bir pavilyon planlı iş evi və revir tikildi. Dizaynı rəqabətə açıldı və qalibiyyət planları Lister Newcombe ilə Stephen Salter və H Percy Adams tərəfindən təqdim edildi. İnşaat işləri 1896 -cı ildə başladı, inşaatçılar George Grimwood & amp Son iş üçün 25,773 funt -sterlinq müqavilə bağladılar. 369 məhbusun yerləşə biləcəyi iş evinin son qiyməti 30.000 funtdan artıq idi. Bir memarın çəkdiyi rəsm, saytın quşbaz görünüşünü göstərir.

Ipswich, şimaldan gələn yeni iş evi və revir, 1899.

Sahənin şimal-qərbindəki bir qəbul blokunda bir qapıçı evi, qəbul palataları və gəzmə kameraları var idi. Birinci mərtəbədə kasıb geyimləri üçün bir mağaza otağı yerləşirdi.

Şimal-şərqdən Ipswich giriş evi, 2001.
& Peter Higginbotham'ı kopyalayın.

Şimal-şərqdən Ipswich qəbul bloku, 2001.
& Peter Higginbotham'ı kopyalayın.

Əsas iş binası, kişilər üçün qərbdə və qadınlar üçün şərqdə iki mərtəbəli qanadlara dəhlizlərlə bağlanan mərkəzi idarə blokundan ibarət idi. Hər qanadın birinci mərtəbəsində gündüz otaqları, hamam, tualet, yataqxanalar və xəstələr üçün yataq otağları vardı. Birinci mərtəbədə yataqxanalar var idi. Mərkəzi məhəllənin qarşısında komitə otağı və usta otaqları vardı. Mərkəzi blokun arxa tərəfində şapel kimi xidmət edən 270 yerlik yemək otağı vardı.

İş evinin xəstəxanası sahənin cənubunda dayandı.

Cənub-şərqdən İpsviç xəstəxanası, 2001.
& Peter Higginbotham'ı kopyalayın.

Saytın yeri və düzeni aşağıdakı 1903 xəritəsində göstərilmişdir.

1930 -cu ildə iş evi reviri Ipswich Borough Ümumi Xəstəxanasına çevrildi və iş evi bölümü Heathfields İctimai Yardım Təşkilatı olaraq davam etdi. 1955 -ci ildə sayt Ipswich Ümumi Xəstəxanasının Heath Road Qanadı oldu. Əsas iş evi binası söküldü, ancaq digər bloklardan bir neçəsi sağ qaldı.

Qərbdən keçmiş Ipswich giriş yeri, 1950 -ci illər.
& Peter Higginbotham'ı kopyalayın.

1937-1946 -cı illərdə valideynləri Heathfields -ə rəhbərlik edən Peter Collier xatırlayır:

Valideynlərimlə birlikdə 1937 -ci ildə buraya köçdük və 1946 -cı ilə qədər Salforda köçdük. Atam köhnə iş evinin ustası təyin edildi və müharibə zamanı inzibati işlərdən məsul olan xəstəxananın müdiri təyin edildi. Xəstəxananın ayrıca bir tibb bacısı var idi.

İş evinin mərkəzi blokunda həm iş evi, həm də revir üçün nəzərdə tutulmuş böyük bir camaşırxana vardı. Böyük bir mətbəx də var idi, amma bunun hər iki hissəyə və ya sadəcə iş evinə xidmət etdiyini xatırlaya bilmirəm. Xəstəxananın cənubunda həm əkin, həm də heyvandarlıqdan ibarət olan (müəyyən mal -qara və donuzlar ola bilər və bəzi işləyən atlar ola bilər) geniş bir əraziyə sahib idi. Bağlar da var idi. İş evində, əmək qabiliyyətli məhkumların əl işlərinə nəzarət edən bir əmək ustasının nəzarəti altında bir "əmək həyəti" var idi. logları kəsmək.

Aşağıdakı fotoşəkil, atamın təxminən 1937-ci ildə çəkdiyi iş evinin ön tərəfidir. Yaşayış yerimiz sol tərəfdən birinci mərtəbədən və bütün birinci mərtəbədən ibarət idi.

Heathfields giriş bloku cənub-şərqdən, c. 1937.
Peter Collier -i kopyalayın.

İş evindəki həyat, 1912 -ci il "İş Evi Topu" nun altındakı şəklin keçəcəyi bir şeydirsə, ən azından işçilərin və Qəyyumların düşündüyü qədər sosial hadisələrdən tamamilə məhrum deyildi. Lakin divarları bəzəyən mətnlər icraatla bir qədər ziddiyyət təşkil edir.

Ipswich İş Evi Topu, 1912.
Peter Collier -i kopyalayın.

St John Uşaq Evi

Kasıb uşaqlar üçün ayrı bir ev ilk dəfə təxminən 1870-ci ildə Ipswich Birliyi tərəfindən təklif edilmişdi. Bu, o vaxt metropoliten olmayan birliklər üçün qeyri-adi bir addım idi və bəlkə də Great Whip Street iş evində yer çatışmazlığının nəticəsi ola bilərdi. 1871 və 1873 -cü illərdə oğlan və qızların yerləşdiyi ayrı qanadlarla əhatə olunmuş mərkəzi bloklu uzun bir bina üçün planlar hazırlanmışdır. Nəhayət 1879 -cu ildə Bloomfield Street -də tikilən bina 80 oğlan və 50 qızı qəbul edirdi. Oğlanlara torpaqda, dərzilik, ayaqqabı və dülgərlikdə işləmək öyrədildi. Qızlara məişət xidməti üçün onları tikmək və digər məişət bacarıqları öyrədildi. Kiçik bir revir daha sonra əlavə edildi.

Ipswich St John Uşaq Evi, 1927.

Ipswich St John Uşaq Evi, c.1910.
& Peter Higginbotham'ı kopyalayın.

Ipswich St John Uşaq Evi, c.1910.
& Peter Higginbotham'ı kopyalayın.

Ipswich St John's Uşaq Evində dülgərlik emalatxanası, c.1910.
& Peter Higginbotham'ı kopyalayın.

Ipswich St John Uşaq Evi, 1900 -cü illərin əvvəlləri.
& Peter Higginbotham'ı kopyalayın.

Ipswich St John Uşaq Evi, 1900 -cü illərin əvvəlləri.
& Peter Higginbotham'ı kopyalayın.

Ipswich St John Uşaq Evi, 1900 -cü illərin əvvəlləri.
& Peter Higginbotham'ı kopyalayın.

Ipswich St John Uşaq Evi, 1900 -cü illərin əvvəlləri.
& Peter Higginbotham'ı kopyalayın.

Daha sonra Freelands kimi tanınan əmlak 1970 -ci illərdə söküldü. Sayt indi bir yaşayış massividir.

Heyət

Məhkumlar

Rekordlar

Qeyd: bir çox depo, şəxsləri tanıdan qeydlər üçün 100 ilə qədər bağlanma müddəti tətbiq edir. Uzun məsafəyə səyahət etməzdən əvvəl həmişə məsləhətləşmək istədiyiniz qeydlərin əlçatan olub olmadığını yoxlayın.

  • Suffolk Record Office, Gatacre Road, Ipswich IP1 2LQ. Holdinqlərə aşağıdakılar daxildir: Qəyyumların dəqiqə kitabları (1835-1930) Doğumlar (1836-1938) Ölümlər (1836-1933) Creed qeydləri (1906-50) St John's Uşaqlar Evinin etiqad qeydləri və qeyd kitabları (1882-1950) və s.

Bağlantılar

Təsdiq


Başqa cür göstərilmədiyi təqdirdə, bu səhifə () müəllif hüquqları Peter Higginbothamdır. Məzmun icazəsiz olaraq təkrarlana bilməz.


Tarix

1689 -cu ilə aid olan qeydlərə görə, indi Ipswich Inn olan mülk, çoxsaylı evlərin yeri olmuşdur. Əvvəlcə Robert Peynə mülkü satan cənab Thomas Bracy -yə məxsus bir kərpic ev idi, 'İpswich kilsəsinə ağsaqqal'. Qeydlərdə bildirildiyi kimi, o, cəmiyyətin təhsilini inkişaf etdirmək üçün qeyrəti olan bir adam idi. 1689 -cu ildə cənab Paine, malikanəsinə və meyvə bağı, bağçası və s. Olan üç hektar torpaq sahəsini 12 fevral 1689 -cu ildə oğlu Robert Paine Jr. -a keçirdi (IPS. Deeds 5: 590).

Bir il sonra, iki və üçdə üç hektar ərazidən ibarət olan əmlak 30 Sentyabr 1690-cı ildə cənab Francis Wainwright-a satıldı (Ips. Deeds 5: 326.) Wainwrights məşhur bir ailə idi-Francis, mühacir, gənclik çağında Pequot savaşında böyük fərqlərlə xidmət etdi. Zəngin bir tacir və görkəmli bir vətəndaş oldu. 19 may 1692 -ci ildə öldü.

Oğlu, eyni zamanda Francis olaraq da bilinir, 1686 -cı ildə Harvard Kollecini bitirdi. Alay polkovniki, Town Clerk, General Court, Feoffee və General Sessions Court ədalət nümayəndəsi idi. 3 avqust 1711 -ci ildə öldü.

Yaşının qırx səkkizinci ilində 1740-cı ildə mülk yenidən kapitan Tomas Staniforda satıldı. Kapitan Staniford, qeydlərə görə, 28 fevral 1740 -cı ildə ölənə qədər evi zəbt edən & ldquogentlemen & rdquo idi. Vəsiyyətnaməsi 7 sentyabr 1778 (Pro. Rec. 353: 206) və əmlakının inventarı, 9 Dekabr 1778 (353: 316), İnqilab dövrünün gözəl malikanələrindən birinin o dövrdə mövcud olan şişirdilmiş dəyərlərdəki əşyalarını ortaya qoyur. Bəzi əşyalar o günün bir bəyinin qarderobunu və müxtəlif mebel əşyalarını ifadə edən maraq doğurur.

Kapitan Tomas Stanifordun oğlu da Kapitan idi və adı Ceyms idi. Kapitan Ceyms Staniford, kərpic ucları olduğu üçün tez -tez "köhnə kərpic" kimi xatırlanan malikanəni işğal etdi və bir qonaqlıq saxladı. Richard Dummer Jewett, 28 May 1803 (172: 178) ilə bitişik ərazinin beş və üçdə bir hissəsinin yarısını satın aldı.

James Staniford və oğlu Jamesin varisləri "kərpic evi" və səkkiz yarım hektar ərazini 10 iyun 1830 (259: 76) Dr Thomas Manningə satdılar. Doktor Manning oğlu "köhnə kərpic" ini Charleston -dan Dr. Joseph Manning -ə satdı, SC, 27 dekabr 1830 (266: 73) və onu John Jewett -ə ötürdü, 9 dekabr 1835 (290: 121) ). Cənab Jewett, hələ də əla mühafizədə olan köhnə malikanəni yıxdı və bir neçə il əvvəl alınıb cənab John B. Brown və Mr. Harry B. Brown tərəfindən sökülmüş kərpicdən tikilmiş evini öz yerinə tikdi.

Əmlak daha bir neçə ailənin yanından keçdi və nəticədə 27 Mart 1814 -cü ildə Susanna Wilcomb'a məxsus oldu və mülkünü Metodist Episkop Kilsəsinin qəyyumlarına satdı. Daha sonra bu əmlak üzərində bir görüş evi tikildi və indiki kilsə tikilənə qədər kilsə tərəfindən istifadə edildi. Lot daha sonra Metodist Episkop Kilsəsinin qəyyumları tərəfindən 17 May 1862 -ci ildə Robert Jordana satıldı. Robert Jordan, müharibədən sonra ümumi tacir kimi həyatını təmin edən Vətən Müharibəsi veteranı idi. Cənab Jordan bu evi 1863 -cü ilin aprelində inşa etdi. İllər sonra, evin arxasındakı ofisində xəstələrini müalicə edən yerli həkim Dr. Baileyə məxsus idi.

Robert Jordan evi, tarixi İpsviçin mərkəzində bir hektar ərazidə yerləşən İtalyan stilində bir Viktorianın gözəl bir nümunəsidir. Əmlakın arxa tərəfində, 1800 -cü illərin əvvəllərində İpsviçdə çiçəklənən ipəkqurdu/ipək sənayesi üçün tut kolları yetişdirilən inkişaf etmiş terraslı torpaqlar var. Interesting architectural features of the house include the Belvedere on the third-floor roof, the curved front stairway, original ceiling moldings, and the ice house at the rear of the main house, which was part of the &ldquosummer kitchen&rdquo. The carriage house is at the back of the property.

Margaret and I bought this house in 1996. We had been on Pleasant Street for twenty-two years, and after our three kids grew up got married, Margaret decided we needed more room. A bed and breakfast was not in our plans but we began to think of the fun it would be meeting new people, and sharing our home with strangers that wanted to pay us for being here (a no-brainer). So, out of those thoughts and dreams, came our B&B, which grew to become The Ipswich Inn.

This is our 20th year. All we wanted and wished for has come true. This has been a great adventure that continues to bring more and more people into our lives that have become friends. We truly hope your stay with us and your meal will be as pleasant and restful as the joy we have in bringing it to you.


The Regent Theatre Ipswich opened in 1929 as a cine-variety hall. At 7.00pm on Monday November 4th, the entrance doors of the new Regent, Ipswich opened and into its spacious foyer crowded nearly 2,000 Ipswich people who had come to witness this momentous occasion.

Ipswich Regent Theatre Opening Night 1929

Opening night screening of The Last of Mrs. Cheyney

1963 Show Poster for The Beatles Headlining at the Ipswich Regent Theatre then known as The Gaumont

The Beatles Headlining at the Ipswich Regent Theatre in 1963 then known as The Gaumont

Outside the theatre a large queue had formed, filing past Botwoods Garage. As a Ransomes steam lorry tooted its whistle, the staff of the Regent lined up for their first inspection by the manager, Albert E. Crabb who checked their ‘electric’ torches.

On the stage, the Mayor of Ipswich, Dr Hossack, performed the opening ceremony musical numbers were played on the brand new Wurlitzer organ by the resident organist Frank Newman F.R.C.O. that included the Merry Wives of Windsor by Otto Nicolai. The film chosen to open the venue then began – “The Last of Mrs Cheyney” starring Norma Shearer and Basil Rathbone – an ‘all-talking’ picture with front circle seats costing 2s / 4d.

The luxurious Regent restaurant enhanced a visit to the theatre and, if desired, tea could be served in any of the fourteen boxes at the rear of the stalls. The boxes and the Manager’s cottage at the rear of the theatre are unique features of the Regent.

Before World War II, the stage was not used to any great extent, although up to the mid-1930’s, the 18 piece Regent Orchestra, under the direction of Louis Baxter frequently entertained the audiences. Most theatre orchestras were disbanded in the late 1930’s and the organ then became the principal musical attraction.

During the war the Regent provided much needed escapism and helped sustain public morale. After the war, The Regent flourished and enjoyed an attendance boom. Also during this period, the stage was employed in the presentation of Ipswich Civic Concerts. The stage was also used for the presentation of Sadler’s Wells Ballet, Carl Rosa Opera and one-night band shows.

The popularity of cinema in the 1930’s and 40’s was so great that another cinema in Ipswich, The Ritz, was opened in 1937. But the advent of television in the 1950’s proved a testing time for cinemas up and down the country and even the highly successful Regent, by now known as the Gaumont, did not survive intact. To allow the cinema to become more profitable, the restaurant was closed down and replaced by the Victor Sylvester Dance Studio.

In the late 1950’s the ‘pop’ music phenomenon exploded. Buddy Holly and the Crickets started off the craze at the Gaumont and since then thousands of international artists have graced the theatre’s stage including the Beatles, Tina Turner, The Bay City Rollers, Tom Jones, Chris Rea, Status Quo and many of today’s top artistes.

From 1958, local musicians and dramatic societies were encouraged to perform at East Anglia’s largest theatre. These included the Ipswich Operatic Society, the Gilbert and Sullivan Society and later the Co-op Juniors. The programme has since included a wide range of productions including professional touring theatre, opera, ballet, comedy and full-scale orchestras.

By 1965 the proprietors, The Rank Organisation, were sufficiently confident of the future to spend £50,000 on a major modernisation and redecoration programme. But by the 1970’s, the large cinemas that had been so successful in the 30’s and 40’s proved to be less economically viable.

The Gaumont’s dance studio was converted to a luxury 200-seat cinema, which could be rented out for use by the local business community. Rank also proposed to convert the main auditorium to a multi-screen complex. However, after a great deal of persuasion, Rank’s plans were abandoned because the auditorium was established as the only local venue of sufficient capacity to stage live shows and concerts despite its limited performance facilities.

The theatre was re-launched in September 1991 after Ipswich Borough Council successfully negotiated the ownership from the Rank Organisation and NCP. Today, Ipswich Borough Council continues to fund the theatre as part of its arts and entertainment portfolio which also includes the Corn Exchange and Ipswich Film Theatre.

Based on an article written by David Lowe, Manager 1958-1989.


Materials and methods

Nanopore sequencing and datasets

Nanopore sequencing data for NA19240 [26], NA12878 [24], and Ashkenazi trio [29] human cell lines are publicly available. A complete description of the datasets, their base calling, mapping, and usage in our study are provided in additional file 1 along with the link to the sources.

We also sequenced the Colo829BL B-lymphoblast cell line using one nanopore PromethION flow cell and Illumina paired-end sequencing at 30× coverage. A complete description of nanopore and Illumina sequencing protocols and data obtained is also provided in Additional file 1.

CpG methylation calling from nanopore data

To call CpG methylation, we benchmarked three model-based approaches: Nanopolish [10], Megalodon [14], and DeepSignal [15]. Nanopolish uses a hidden Markov model to call CpG methylations from raw nanopore data while Megalodon and DeepSignal use neural networks. We called CpG methylation using these tools (with the default parameters) for 12 flow cells of NA12878 publicly available data (Additional file 1) and compared the results with WGBS data from ENCODE project (ENCFF835NTC) [51] and Human Methylation 27 (27k) array from Fraser et al. [25].

Variant calling

We used Clair to call SNVs [22]. We called variants for each chromosome using clair.py callVarBam --threshold 0.2HG122HD34 model. Indels were filtered out. To evaluate variant calling, we compared SNVs called by Clair from nanopore data to those from 1KGP phase 3 [30] (GRCh37 coordinates). Clair’s variant calls were lifted over to GRCh37 human reference genome coordinates using CrossMap [52] for comparison to 1KGP data.

For our in-house Colo829BL sample, we compared Clair variant calls to Strelka [53] v 2.9.10 calls made from paired-end Illumina reads (Additional file 1).

Model training to improve SNV calling

We calculated average qualities and mutation frequencies for each position of each 5-mer window containing an SNV. Mutation frequencies were calculated as the number of instances over coverage for each genomic position in the 5-mer window. Base qualities for a given position were calculated as the average of all base qualities mapped to the position. We used these as inputs to a fully connected artificial neural network classifier composed of four hidden layers with a relu activation function. The first hidden layer is six times larger than the input layer and the size of subsequent hidden layers decreases through a factor two.

We trained three models to compare the classifier using different coverages. NA12878 20 flow cells (24×), NA12878 all flow cells (44×), and HG003 (80×) were used for training. First, we called variants for each dataset using Clair and then determined true and false positives using high-quality variants using the Genome in a Bottle database (GIAB) [27]. Using NA12878 20 flow cell data, a randomly selected balanced dataset of 25 million 5-mers was used for training and 4 million unseen randomly selected 5-mers were used as the validation set. For the NA12878 whole dataset and HG003 sample, the training datasets were 18M and 14.9M, respectively, and validation sets were 2.5M and 2M, respectively (Additional file 2: Fig. S6). The NA12878 20 flow cell model was used for < 30× coverage data, NA12878 all flow cells for 30×–45× coverage data, and HG003 model for > 45 coverage data.

Phasing single nucleotide variants detected from nanopore sequencing

In order to phase nanopore reads and CpG methylation, we first called SNVs for both samples (NA19240 run 1 and Colo829BL) using Clair [22], then used SNVoter to normalize the quality scores and filter out false positives (Fig. 2e and Table 1). Finally, we used WhatsHap [23, 31] v0.18 with the default parameters and --ignore-read-groups on to determine haplotype status for each SNV.

Phasing of nanopore reads and CpG methylations

Phased SNVs and CpG methylation calls were leveraged to phase reads along their CpG methylation to diploid haplotypes. After filtering out a considerable number of false-positive SNVs using SNVoter, we still noticed 10–20% false-positive SNV calls in the datasets (Table 1). These unfiltered false-positive calls, in addition to sequencing errors, can result in reads incorrectly mapping to the SNVs from haplotype 1 when the read would actually belong to the haplotype 2 and vice versa. We noticed reads presenting SNVs from both haplotypes when mapping them to phased SNVs. In NA19240 run 0, out of

3M reads which mapped to at least one phased SNV,

2M reads had SNVs from both haplotypes (Additional file 2: Fig. S7a). To further overcome false positives and the sequencing error problem, we made several filtering steps to account for remnant false-positive SNVs and haplotype ratio (number of SNVs from HP1/HP2 or HP2/HP1). As we analyzed NA19240 run 0, we noticed a lower base quality distribution for false-positive SNVs compared to true positives that could not be filtered out by SNVoter (Additional file 2: Fig. S7b). Therefore, we assigned a minimum base quality threshold to successfully map each read at a phased SNV position. To manage reads containing SNVs from both haplotypes, we defined another threshold, the haplotype ratio, which ensures the reads are assigned to a single haplotype. Based on the quality distribution of SNVs (Additional file 2: Fig. S7b), the proportion of false positives which is between 10 and 20% (Table 1) and haplotype ratios (Additional file 2: Fig. S7a), and also based on empirical phasing at a few known imprinted regions, we used seven as the minimum base quality and 0.75 as haplotype ratio. We also used two as the minimum number of phased SNVs a read must present to be considered for phasing. In order to assign a read to a defined haplotype, a read must satisfy the following criteria:

As the reads are separated to different haplotypes, their associated CpG methylations from processed methylation call file are also separated to the corresponding haplotypes. We have integrated all the steps and filters in our python3 command-line tool, NanoMethPhase. Users can input methylation call data from Nanopolish, phased variant calling file, alignment file, and reference genome to NanoMethPhase (Fig. 3c). NanoMethPhase will output phased reads in aligned format, phased mock WGBS converted format for visualization (see the “Visualization” section Fig. 4c, d), phased methylation calls, and methylation frequency files. The latter can be used for differential methylation analysis to detect DMRs between haplotypes.

Differential methylation analysis

After phasing reads and CpG methylation to haplotypes, NanoMethPhase can perform DMA to detect mono-allelic methylated regions. It uses the DSS R package [36] for DMA. Users can perform all analyses in a command-line interface and directly perform DMA using the dma module of NanoMethPhase on the output phased methylation frequency data to detect DMRs.

Visualization

NanoMethPhase can convert phased reads into separate mock-WGBS bam files using the processed methylation call file from its methyl_call_processor module. Each cytosine in each CpG in each read is converted to a T, A, or N depending on the CpG being called as methylated, unmethylated, or uncalled. These pairs of files can be loaded into a genome browser such as IGV [34] in bisulfite mode for visualization (Fig. 4c, d).


Methods

Strains and growth conditions

Escherichia coli DH5α was used for plasmid amplification. T. reesei Rut-C30 (ATCC 56765), NG14 (ATCC 56767), and PC-3-7 (ATCC 66589) were purchased from ATCC (American type culture collection). T. reesei strain QM6a (ATCC 13631), QM9414 (ATCC 26921), and RL-P37 (NRRL 15709) were respectively purchased from DSMZ (Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen), Institute of Microbiology-Chinese Academy of Sciences, and NRRL (Agriculture Research Service Culture Collection). E. coli was cultured in Luria broth (LB) medium. All the strains of T. reesei were cultivated at 28 °C (200 rpm) in 2× Mandels’ medium (1.0 g/L yeast extract, 3 g/L peptone, 0.6 g/L urea, 2.8 g/L (NH4)2SO4, 4.0 g/L KH2PO4, 0.5 g/L CaCl2, 0.6 g/L MgSO4∙7H2O, 5 mg/L FeSO4∙7H2O, 1.6 mg/L MnSO4∙4H2O, 1.4 mg/L ZnSO4∙7H2O, and 20 mg/L CoCl2∙6H2O) in which 2% glucose, 2% lactose, or 1% (w/v) Avicel was used as carbon source [31]. In addition, all these strains were maintained on potato dextrose agar (PDA) plates at 28 °C for the generation of conidia.

Plasmid construction, Agrobacterium-mediated transformation, and transformants screening

The primers used in this study are listed in Additional file 8: Table S2. LML2.1 [32] was used as a skeleton for the two plasmids, plasmidA734 and plasmidA723, to obtain two types of transformants bearing the ACE3-734 and ACE3-723 protein, respectively. The 5′- and 3′-arms of the homology double exchange for ACE3-734 and ACE3-723 sequences were constructed as described by Zhang et al. [26]. The DNA fragment of the 5′-arm of truncated ACE3-723 (approximately 900 bp) was cloned using the genome of Rut-C30 and the primer pair ace3-1/ace3-2723. Similarly, the fragment of the 5′-arm of native ACE3-734 (approximately 1000 bp) was cloned using the QM6a genome and the primer pair ace3-1/ace3-2734. The 3′-arms of these structures (about 1000 bp) were amplified from Rut-C30 or QM6a genomic DNA using the primer pair ace3-3/ace3-4. KOD-Plus-Neo (TOYOBO, Japan) was used for PCR. Next, the 5′- and 3′-arms of ACE3-723 and ACE3-734 were ligated in an orderly manner into PacI/XbaI and SwaI sites of linearized LML2.1 [32] to form PlasmidA723 and PlasmidA734müvafiq olaraq. The transformation experiments were performed using Agrobacterium-mediated transformation as described by Zhang et al. [32]. Correct intermediate transformants of A723 and A734, obtained by a homologous double exchange, were checked by diagnostic PCR [33] and quantitative PCR (qPCR Additional file 2) [34,35,36] to avoid unspecific locus integration (ectopic integration events). The primer pairs ace3-CF/D70-4 and HG3.6/ace3-CR were used in diagnostic PCR (Additional file 3: Figure S2A-B), which was followed by DNA sequencing (Additional file 3: Figure S2E) to confirm the correct knock-in at the ace3 locus in T. reesei genomes. The single-copy DNA fragment integration in transformed clones was verified by qPCR (Additional file 3: Figure S2C-D). The hygromycin marker gene in the transformants was excised using xylose-induced cre recombinase expression [32], and then the intermediate transformants were turned into the final transformants by excising the hygromycin marker gene. The final transformants were obtained and confirmed by hygromycin sensitive phenotype and with the second-round diagnostic PCR. Thus, the final A723/A734 transformants were used for further analysis.

Cellulase production in a shake flask and fermenter culture

Cellulase production in a shake flask was conducted according to a previously described method [26], with some modification. In brief, conidia (final concentration 10 6 /mL) of T. reesei strains were grown at 28 °C, in 20 mL of 2× Mandels’ medium containing 2% (w/v) lactose or 1% (w/v) Avicel (PH-101, Sigma-Aldrich) as the sole carbon source. The biomass dry weights were indirectly measured by calculating the total amount of intracellular proteins [37]. The supernatant was used for cellulase assays. Mycelia were collected for RNA extraction.

The activity of the produced cellulase was measured as described in another study [38]. In brief, the səhNPCase and səhNPGase activities were determined against 5 mM səh-nitrophenol- d -cellobioside (səhNPC, Sigma-Aldrich) and səh-nitrophenyl β- d -glucopyranoside (səhNPG, Sigma-Aldrich) as substrates in 50 mM sodium acetate buffer at pH 5.0 at 50 °C for 30 min, respectively. The release of səh-nitrophenol was determined by measuring absorbance at 405 nm. One unit of səhNPCase and səhNPGase activities was defined as 1 μmol of səh-nitrophenol released per minute. The CMCase activities were determined by incubation in 50 mM sodium acetate buffer with 1% carboxymethylcellulose (CMC, Sigma-Aldrich), at pH 5.0, 50 °C and for 30 min. The FPase activities were determined using Whatman filter paper as the substrate with a 50 mM sodium acetate buffer at pH 5.0, 50 °C, and for 30 min. One unit of CMCase or FPase activity was defined as the amount of enzyme producing 1 μmol of reducing sugar per min.

Cellulase production in a fermenter culture was conducted according to the method described by Li et al. [39] with some modification. In brief, fermentation was carried out in the 30-L fermenter (Shanghai Bailun Bio-technology Co., Ltd.) with an initial working volume of 10 L at 28 °C for mycelial growth. Seed cultivation was performed as follows: for each strain, about 10 9 conidia were inoculated into 1 L of 2× Mandels’ medium and 20 g/L of glucose, then cultivated by rotation (200 rpm) at 28 °C for 2 days. This culture was poured into 9 L of fresh 2× Mandels’ medium containing 10 g/L of wheat bran and 15 g/L of Avicel in a 30 L jar fermenter. A mixture of glucose and β-disaccharides (MGDS SUNSON ® , Beijing, China) was fed after inoculation. The feeding took place every 6 h, which maintained glucose concentration low, between 0.05 g/L and 0.30 g/L. The temperature was decreased to 25 °C after 48 h for more efficient cellulase production. The dissolved oxygen (DO) and pH were controlled as described by Li et al. [39]. The samples were taken every 24 h, and the supernatant was analyzed for the FPase, səhNPCase, səhNPGase, and CMCase activities. Mycelia were collected for biomass measurement.

RNA extraction and real-time reverse-transcription polymerase chain reaction (RT-qPCR)

The methods used for RNA extraction and RT-qPCR methods are as those described by Chen et al. [33]. In brief, total RNA was extracted from cell fresh weight using a FastRNA Pro Red Kit (MPbio, Irvine, CA, USA). Synthesis of cDNA from total RNA was performed using the TransScript One-Step gDNA Removal and cDNA Synthesis SuperMix (TransGen, Shanghai, China), according to the manufacturer’s instructions. For RT-qPCR, the PerfectStart™ Green qPCR SuperMix (TransGen, Shanghai, China) was used (see Additional file 8: Table S1). The transcriptional levels of the sar1 gene and the RNA of the parental strain were measured for reference calculation and data normalization. Primers used in RT-qPCR are listed in Additional file 8: Table S2.

Pre-treatment and enzymatic hydrolysis of lignocellulose biomass

Dry dilute acid pretreated and bio-detoxified corn stover (containing 37.6% cellulose and 4.4% hemicellulose) was donated by Professor Jie Bao [40]. The hydrolysis efficiency of the crude cellulase was evaluated by mixing 5% (w/v) dry pretreated and bio-detoxified corn stover as a substrate and the same amount of crude enzyme (5 mL) in 50 mM phosphate buffer to a final volume of 20 mL at 50 °C and pH 5.0 for 72 h. The glucose concentration in the supernatant was determined using a glucose assay kit and glucose yield was analyzed as described by Li et al. [39]. In brief, the glucose concentration in the supernatant was measured with the GOD (glucose oxidase) method. The glucose yield was calculated as follows: Glucose yield (%) = (Glucose (g) × 0.9 × 100)/(Cellulose in substrate (g)).

Statistical analysis

All experiments were performed with at least three independent samples with identical or similar results. The error bars indicate standard deviation (SD) of the mean of triplicates. Student’s t test was used to compare two samples, and Duncan’s multiple-range test was used for multiple comparisons. Within each set of experiments, səh < 0.05 was considered significant.


Videoya baxın: LINCOLN CITY VS IPSWICH TOWN. 0-1. CELINA RETURNS, INSANE ATMOSPHERE u0026 LIMBS AS IPSWICH WIN!!!